Mitruma absorbcija
Liofilizētas konfektes ir ārkārtīgi higroskopiskas, kas nozīmē, ka tās viegli uzsūc mitrumu no gaisa. Ja tas tiek pakļauts mitrai videi, tas var ātri absorbēt ūdeni, kā rezultātā tas var zaudēt raksturīgo kraukšķīgumu un kļūt mīksts vai pat lipīgs. Tas ne tikai ietekmē tekstūru, bet arī nodrošina labvēlīgu vidi mikroorganismu augšanai, kas var izraisīt bojājumus.

Oksidācija
Lai gan liofilizēšanas process atdala lielāko daļu ūdens, kas kavē daudzu bojāšanos izraisošu mikroorganismu augšanu, dažās konfektēs esošie tauki un eļļas joprojām var būt jutīgi pret oksidēšanos. Laika gaitā gaisa iedarbība var izraisīt šo komponentu sasmakšanu, izraisot piegaršu un smaku, kas padara konfektes nebaudāmas.

Ekstrēma temperatūra
Liofilizēti kaltētu konfekšu uzglabāšana ļoti augstā temperatūrā var paātrināt bojāšanās procesu. Siltums var izraisīt ātrāku ķīmisko reakciju norisi, izraisot krāsas, tekstūras un garšas izmaiņas. No otras puses, ārkārtīgi zemas temperatūras, lai gan parasti neizraisa bojājumus, dažkārt var izraisīt konfekšu trauslumu un vieglāk saplīst, tādējādi ietekmējot to kvalitāti un izskatu.

Mikrobu piesārņojums
Lai gan žāvēšana liofilizē ievērojami samazina mikrobu slodzi, tā pilnībā nesterilizē konfekti. Ja konfektes nonāk saskarē ar piesārņotām virsmām vai ražošanas, iepakošanas vai uzglabāšanas laikā tiek ievērotas nepareizas darbības, pastāv mikrobu augšanas risks. Tas var izraisīt bojājumus, pelējuma veidošanos un potenciālus veselības apdraudējumus, ja to patērē.

Uzglabāšanas laika aprēķini
Optimālos uzglabāšanas apstākļos, kas parasti ietver konfekšu turēšanu vēsā, sausā vietā hermētiski noslēgtā traukā, liofilizētas konfektes var kalpot no vairākiem mēnešiem līdz gadam vai ilgāk. Tomēr tas var atšķirties atkarībā no konfekšu veida, to sastāvdaļām un īpašajiem uzglabāšanas apstākļiem. Piemēram, konfektēm ar lielāku tauku vai cukura saturu var būt īsāks glabāšanas laiks, salīdzinot ar konfektēm ar vienkāršāku sastāvu.
